水污染主要是由于人类排放的各种外源性物质（包括自然界中原先就有的和没有的），进入水体后，超出了水体本身自净作用（就是江河湖海可以通过各种物理、化学、生物方法来消除外源性物质）所能承受的范围，就算是水污染了。

危害工农业：
　　　工业用水需先进行净化，要花更多的钱，造成资源能源的浪费，生产停顿；用废水浇灌农作物会使作物减产，品质降低，甚至使人畜受害，大片农田遭受污染，降低土壤质量。

难以治理：
　　　工农业生产的危害水质污染，为了保护环境工业必须投入更多的处理费用，许多工厂都不愿花钱，而污染水一旦进入河流就很难再进行有效的净化。

危害生态环境：
　　　水污染破坏了水生生物的生存环境，导致它们死亡，同时也使很多以它们为食的生物面临生存危机。